Основним застосуванням цих мембранних фільтрів є фільтрація повітря, газів або хімічних речовин. Вони виготовляються тільки з ПТФЕ (політетрафторетилену) і тому є незмінно гідрофобними. На відміну від інших (гідрофільних) типів фільтрів, вони не змочуються вологою, що міститься в повітрі, дозволяючи повітрю проходити безперешкодно навіть при низьких диференціальних тисках. Мембранні фільтри з ПТФЕ мають відмінну хімічну сумісністю (pH 1-14), тому вони також використовуються для фільтрації розчинників і кислот, до яких не стійкі інші типи фільтрів. З огляду на гідрофобні характеристики, фільтри з ПТФЕ необхідно змочувати етанолом або метанолом перед фільтрацією водних розчинів середовищ.